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Fulltext:




Einladung zum
Mathematischen Kolloquium
Fachbereich Mathematik -- Informatik
Wintersemester 2015/2016
Am Dienstag, 17. November 2015 spricht Herr
Univ.-Prof. Mag. Dr. Andreas Futschik
(Institut für Angewandte Statistik, Johannes Kepler Universität Linz)
,,On the inadmissibility of common population genetic estimates
and their improvement by using shrinkage"
Abstract:
Two key parameters in population genetics are the scaled mutation parameter theta and
the scaled recombination rate rho. Estimates of these parameters have been obtained
either from suitable summary statistics, or via more sophisticated methods such as
maximum (composite) likelihood. We show that there is often room for uniform
improvement of these estimates.
We first explain why the popular Ewens-Watterson estimate of theta is inadmissible in
terms of the mean squared error under the classical Wright-Fisher model and how it can
be uniformly improved. Also other estimates of theta such as the MLE can be improved,
although to a smaller extent.
Then we look at estimating the scaled recombination rate rho, and explore possible gains
that can be obtained with the two popular (approximate) Bayesian estimates LDhat and
LDhelmet. It turns out that there is often still room for uniform improvement. This may be
surprising, as it is well known that Bayesian estimates are admissible under weak
assumptions.
Both for Wattersons estimate and when estimating recombination, the improvement can
be achieved without a lot of computational effort. However, as no explicit formulas for bias
and variance are available when estimating rho, the coefficients turning up in the
improvement need to be estimated from simulations.
The talk will start with a short introduction into population genetics, the Wright-FisherModel and the other mentioned statistical methods.
(Einladungsvorschlag von Herrn Werner Brannath)
Der Vortrag findet statt am Dienstag, 17. November 2015 um 16 Uhr c.t.
im Raum 1090, 1. Ebene des Mehrzweckhochhauses (MZH) der Universität Bremen,
Bibliothekstraße, 28359 Bremen.
Zuvor (ab 16.00 Uhr) gibt es Kaffee/Tee und Gebäck im Raum MZH 7260.
Alle Interessierten sind herzlich willkommen.
R.-E. Hoffmann als Kolloquiums-Beauftragter.
08.11.2015
08112015_Math_Kolloquium_Andreas Futschik_17112015_Uni_Bremen.doc
Sehr geehrte Damen und Herren, Sehr geehrte Damen und Herren, birgitf Microsoft® Word 2013 Microsoft® Word 2013 Sun Nov 08 23:01:09 2015 Sun Nov 08 23:01:09 2015 yes 1 no 595.2 x 841.92 pts (A4) 141686 bytes no 1.5
Invitation_Math_Colloquium_with_Abstract_20151117
Einladung_Mathe-Kolloquium_mit_Abstract_20151117


 



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